মাইটোকন্ড্রিয়া একটি দ্বিস্তর বিশিষ্ট আবরণী বা ঝিল্লি দিয়ে আবৃত থাকে। ঝিল্লিটি লিপিড ও প্রোটিন সমৃদ্ধ লাইপোপ্রোটিন দিয়ে গঠিত। বহিঃস্তরটি মসৃণ কিন্তু ভিতরের স্তরটি ভিতরের দিকে ভাঁজ হয়ে থাকে। এদের ক্রিস্টি বলে। ক্রিস্টির গায়ে সুবিন্যস্তভাবে বৃন্তযুক্ত গোলাকার বস্তু থাকে। একে অক্সিজোম বলে। অক্সিজোমে উৎসেচকগুলো সাজানো থাকে। মাইটোকন্ড্রিয়নের ভিতরে থাকে ম্যাট্রিক্স। নিচে মাইটোকন্ড্রিয়ার চিহ্নিত চিত্র দেওয়া হলো–
